Hạt Phủ doãn Tông tòa Thakhek được thành lập vào ngày 21/12/1950, khi Hạt Đại diện Tông tòa Lào được tách ra làm hai. Phần phía tây ở Thái Lan được đổi tên thành Hạt Đại diện Tông tòa Thare, trong khi phần thuộc Lào trở thành Hạt Phủ doãn Tông tòa Thakhek. Ngày 24/2/1958, Hạt Phủ doãn Tông tòa được nâng cấp thành một Hạt Đại diện Tông tòa. Vào năm 1963, Hạt Đại diện Tông tòa Thakhek được đổi tên thành Hạt Đại diện Tông tòa Savannakhet, mặc dù tòa giám mục vẫn được đặt tại Thakhek ở tỉnh Khammuane. Năm 1967, phần phía nam Hạt Đại diện Tông tòa được tách ra để thành lập Hạt Đại diện Tông tòa Pakse.